Polisakkaritlerin sindirimi ağızda çiğneme ile başlar. Besinlerin çiğnenmesi ile nişasta ve glikojen serbest hale gelir. Tükürükte bulunan pityalin enzimi. nişasta ve glikojenin bir kısmını disakkaritlere kadar parçalar. Pankreas tarafından salgılandıktan sonra ince bağırsaklara gelen amiliz ve ince bağırsaklardan salgılanan enzimlerin (disakkaridazlar) etkisiyle ince bağırsaklarda polisakkaritler ve disakkaritler monosakkaritlere kadar parçalanırlar. Monosakkaritler de ince bağırsaklardan çoğu basit difüzyonla, bir kısmı da aktif taşınma ile kana geçerek karaciğere taşınır. Karaciğerde galaktoz ve früktoz da glikoza dönüştürülür ve glikojen halinde depo edilir ya da kan dolaşımı ile dokulara taşınır.Vücutla deposu sınırlı olduğu için enerji ihtiyacından fazla olan karbonhidratlar yağa dönüştürülerek saklanır ve bu şekilde depo edilir.
